Młodsza Specjalistka / Młodszy Specjalista ds. Analiz Bioinformatycznych

w ramach realizowanego projektu pt. „Toward tumor-agnostic multiomic biomarkers in early detection of non-small lung cancer relapse”. Projekt finansowany przez Agencję Badań Medycznych w ramach programu TRANSMED I .

Miejsce pracy: Gdańsk

wymiar czasu pracy: 2 x 1 etat

zatrudnienie w oparciu o umowę o pracę

DO ZADAŃ OSOBY ZATRUDNIONEJ NA TYM STANOWISKU BĘDZIE NALEŻAŁO:

• analiza danych z sekwencjonowania Oxford Nanopore, w tym wzorców metylacji DNA oraz rozkładów długości fragmentów,
• opracowanie modeli predykcyjnych z wykorzystaniem metod uczenia maszynowego do wykrywania ctDNA pochodzenia nowotworowego na podstawie cech epigenomicznych i fragmentomicznych,
• projektowanie i implementacja algorytmów klasyfikacyjnych opartych na aktywności regionów regulatorowych i pozycjonowaniu nukleosomów,
• przygotowanie czystego, udokumentowanego i możliwego do odtworzenia kodu,
• wstępna analiza i interpretacja danych uzyskanych w wyniku sekwencjonowania,
• ścisła współpraca z zespołami klinicznymi i biologii molekularnej w zakresie interpretacji danych i walidacji klinicznej,
• prowadzenie dokumentacji badawczej oraz przygotowywanie materiałów do publikacji naukowych i wniosków patentowych,
• prezentowanie wyników badań podczas spotkań zespołu projektowego, seminariów naukowych, konferencji krajowych i międzynarodowych oraz innych wydarzeń naukowych.

OD KANDYDATÓW OCZEKUJEMY:

• licencjat/stopień inżyniera lub magisterium z bioinformatyki, matematyki, biologii, biotechnologii lub kierunków pokrewnych,
• doświadczenie w pracy z językami Python i R oraz zastosowaniach uczenia maszynowego,
• mile widziane doświadczenie w analizie danych obrazowych oraz ich integracji z danymi molekularnymi,
• znajomość analizy bioinformatycznej danych typu genome-wide będzie dodatkowym atutem,
• umiejętność planowania, przeprowadzania i dokumentowania eksperymentów naukowych,
• biegła znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie.

OFERUJEMY:

• umowę o pracę na czas określony na pełen etat,
• ilość etatów: 2
• pracę w najlepszej uczelni medycznej w Polsce, posiadającej status uczelni badawczej,
• możliwość podnoszenia kompetencji w ramach obejmowanego stanowiska,
• atrakcyjny pakiet świadczeń pozapłacowych.